Nos Açores surge em zonas declivosas, em matos diversos, em florestas naturais e por vezes em bermas de estrada, sendo menos exigente em humidade do que a H. suberecta (há porém lugares na Terceira onde as duas espécies coexistem).

No arquipélago da Madeira ocorre apenas na ilha da Madeira. Nos Açores está presente em São Miguel, Terceira, São Jorge, Pico, Faial, Flores e Corvo. Sobre o género Huperzia nas ilhas, leia-se o artigo The genus Huperzia (Lycopodiaceae) in the Azores and Madeira, disponível AQUI.